table Mendeley

THE EFFECTIVENESS OF MEMBERS OF THE FAMILY BACILLACEAE AGAINST SOYBEAN FUNGAL PATHOGENS

Research article
DOI:
https://doi.org/10.60797/IRJ.2025.153.66
Issue: № 3 (153), 2025
Suggested:
22.11.2024
Accepted:
28.02.2025
Published:
17.03.2025
81
2
XML
PDF

Abstract

The aim of the work was to study the antibiotic activity of representatives of the Bacillaceae family against pathogens of fungal diseases of soybean that are relevant for the Krasnoyarsk Territory. As representatives of the Bacillaceae family, we used 22 strains of Bacillus altitudinis, B. atrophaeus, B. cereus, B. megaterium, B. simplex, B. subtilis, Peribacillus simplex and Bacillus sp., isolated by us from agricultural soils of the region. As test cultures, we used 2 isolates of Alternaria sp., 2 isolates of Fusarium sp. and 1 isolate of Sclerotinia sclerotiorum, isolated from soybean plants affected by diseases. The antibiotic activity was tested using the opposite culture method. The area of colonies of the test culture in the presence of the antagonist strain in % of the control variant (without the antagonist) was used as an indicator. It was found that the antibiotic activity of the studied strains varied from the absence of antagonism (the colony area of the test culture did not differ from the control variant) to almost complete suppression of the test culture (the colony area was 5,4% of the control) depending on the antagonist strain and the test culture. Two-factor analysis of variance confirmed the statistical significance (p<0.001) of the influence of the factors "Strain-antagonist", "Test culture" and the effect of the interaction of the factors "Strain-antagonist" x "Test culture" on the antibiotic activity with the effect sizes of 57,33%, 15,87% and 26,16%, respectively. Correlation analysis with subsequent factor analysis of the correlation matrix showed that the studied strains produce at least two independent antifungal factors. The first factor is active against representatives of the genera Alternaria and Fusarium, the second – against Sclerotinia sclerotiorum. Based on the obtained results, a combination of Bacillus atrophaeus CX6 and Pa2 Bacillus sp. strains was proposed to protect soybeans from fungal diseases.

1. Введение

Сою выращивают по всему миру, ведущими странами являются США, Аргентина, Бразилия, Индия. Мировое производство сои с каждым годом увеличивается

,
. В России также наблюдается ежегодное увеличение посевных площадей под соей, что свидетельствует о растущем интересе к данной культуре. Так, согласно данным Росстат, только за последние пять лет (2020-2024 г.г.) посевные площади под этой культурой выросли в 1,5 раза, достигнув в 2024 г. 4,3 млн. га.
.

По результатам мониторинга, проведённого в 2023 г., и охватившего 64,6% посевной площади под соей, на 13,8% обследованных площадей были распространены заболевания, наиболее вредоносными из которых были грибные болезни: септориоз (возбудитель – Septoria glycines), аскохитоз (возбудитель – Ascochyta sojaecola), пероноспороз (возбудитель – Peronospora manshurica) и фузариоз (возбудители – комплекс грибов р. Fusarium), а также бактериоз

.

Несмотря на то, что основную долю рынка средств защиты растений от грибных болезней в России и за рубежом занимают химические фунгициды, в последние десятилетия во всём мире наблюдается устойчивая тенденция к внедрению в систему защитных мероприятий биофунгицидов, представляющих собой препараты на основе живых микроорганизмов и/или их метаболитов. Данные препараты являются относительно дешёвыми и (в отличие от химических фунгицидов) экологически безопасными. Однако широкое внедрение биофунгицидов тормозится нехваткой эффективных штаммов, особенно – адаптированных к почвенно-климатическим условиям конкретных регионов.

Текущий (на 18.09.2024 г.) перечень биологических препаратов, согласно Государственному каталогу пестицидов и агрохимикатов, разрешенных к применению на территории Российской Федерации, включает всего 9 фунгицидов на основе бактерий р. Bacillus, р. Pseudomonas и грибов р. Trichoderma. Данные препараты направлены на предотвращение развития таких болезней как церкоспороз, пероноспороз, фузариозные корневые гнили, фузариозное увядание, антракноз, аскохитоз, фузариоз, плесневение семян, альтернариоз при слабом развитии болезни

. В связи с этим поиск новых агентов для разработки биопрепаратов для защиты посевов сои от грибных болезней является актуальной задачей.

Цель исследования – изучить антибиотическую активность представителей семейства Bacillaceae в отношении актуальных для Красноярского края возбудителей грибных болезней сои.

2. Объекты и методы

В работе изучали антибиотическую активность 22 штаммов-антагонистов, выделенных из почв Красноярского края (Bacillus altitudinis, B. atrophaeus, B. cereus, B. megaterium, B. simplex, B. subtilis, Peribacillus simplex и Bacillus sp.) в отношении возбудителей грибных болезней сои. Один из штаммов (RSA 1 (B-13893) B. atrophaeus) ранее был запатентован авторами в качестве основы для биопрепарата против грибных болезней сои (Патент на изобретение RU 2791332 C1 07.03.2023), остальные штаммы на антагонизм против возбудителей болезней сои не тестировались. В качестве тест-культур использовали 2 изолята Alternaria sp. (Alt C20, Alt C24), 2 изолята Fusarium sp. (Fus C7, Fus C15) и 1 изолят Sclerotinia sclerotiorum (Scler C16). Идентификацию бактерий проводили методами MALDI-TOF масс-спектрометрии, по нуклеотидной последовательности гена 16SpРНК; идентификацию грибов проводили по характеру спороношения и совокупности других культурально-морфологических признаков.

Проверку антибиотического действия изучаемых штаммов на тест-культуры проводили стандартным методом двойных культур в чашках Петри
,
. Питательной средой служила среда №2 ГРМ ФБУН ГНЦ ПМБ половинной концентрации
, контролем служили чашки Петри с тест-культурами без антагонистов (рис. 1). Чашки с посевами инкубировали в течение 10 суток при температуре 25 ± 1 °C, после чего измеряли площадь колоний тест-культур в присутствии изучаемых штаммов и выражали её в % от контроля.
Метод встречных культур на примере Alt C20: 1 – рост тест-культуры в контроле; 2 – рост тест-культуры в присутствии штамма СХ5

Рисунок 1 - Метод встречных культур на примере Alt C20:

1 – рост тест-культуры в контроле; 2 – рост тест-культуры в присутствии штамма СХ5

Измерение площади колоний проводили по фотографиям с помощью программы ImageJ. Для оценки статистической значимости и показателей силы влияния факторов «штамм-антагонист» и «тест-культура гриба» использовали двухфакторный дисперсионный анализ. После выполнения дисперсионного анализа проводили попарную оценку статистической значимости различий между индивидуальными средними с помощью тестов Шеффе и Тьюки
. Однотипность реакции тест-культур на набор изучаемых штаммов оценивали по коэффициенту корреляции Пирсона с последующим анализом корреляционной матрицы с помощью факторного анализа. В качестве программного обеспечения для дисперсионного, корреляционного и факторного анализа использовали StatSoft, Inc. (2007) STATISTICA version 8.0.

3. Результаты и их обсуждение

Зафиксированный в эксперименте антибиотический эффект штаммов-антагонистов варьировал от практически полного подавления роста тест-культуры до отсутствия антибиотического воздействия (табл. 1, рис. 2, 3).

Таблица 1 - Усреднённые по трём повторностям площади колоний тест-культур в присутствии изучаемых штаммов-антагонистов

Штамм, таксономическая принадлежность

Площади колоний тест-культур (в % к контролю)

Alt C20

Alt C24

Fus C7

Fus C15

Scler C16

Pa1, Bacillus thuringiensis

44,4

57,6

51,1

55,4

39,2

Pa2, Bacillus sp.

48,6

39,6

62,3

75,9

5,4

Pa3, Bacillus sp.

31,9

24,5

45,8

64,4

44,9

RSA1, (B-13893), Bacillus atrophaeus

30,1

15,0

15,8

57,6

60,7

RSA11, Bacillus subtilis/ Bacillus atrophaeus

28,4

40,2

49,9

53,3

43,6

RSA12, Peribacillus simplex

82,3

90,5

100,0

100,0

90,2

RSA15, Bacillus simplex

51,3

39,7

56,0

59,1

47,1

RSA16(1), Bacillus atrophaeus

39,7

33,2

51,6

56,7

33,1

RSA16(2), Bacillus atrophaeus

35,3

37,1

34,9

48,5

38,5

RSA17, Bacillus cereus group/ Bacillus subtilis

42,9

39,1

50,8

55,1

51,0

RSA18, Bacillus atrophaeus

47,7

39,7

56,1

55,2

52,1

RSA19, Bacillus atrophaeus

39,4

39,5

46,7

51,4

37,0

RSA2, Bacillus altitudinis

35,2

50,8

59,4

85,9

34,0

RSA20(1), Bacillus subtilis

42,5

38,7

50,5

53,8

54,7

RSA20(2), Bacillus subtilis

29,1

41,9

44,1

47,8

17,6

RSA4, Bacillus megaterium

81,2

57,8

100,0

100,0

55,7

RSA8, Bacillus atrophaeus

46,5

36,5

45,3

52,3

10,9

RSA9, Bacillus atrophaeus

47,4

38,7

44,9

52,7

49,0

АЛ3, Bacillus atrophaeus

43,4

33,9

46,6

55,2

32,2

АЛ4, Bacillus sp.

39,5

36,6

48,6

46,9

54,6

СХ5, Bacillus cereus

49,2

46,2

33,1

51,8

65,6

СХ6, Bacillus atrophaeus

7,2

15,2

38,0

40,3

6,2

Пример зависимости антибиотического эффекта от штамма-антагониста при использовании одной и той же тест-культуры (Fus C15): 1 – штамм RSA9, подавление роста тест-культуры ярко выражено; 2 – штамм RSA4, подавление роста тест-культуры отсутствует

Рисунок 2 - Пример зависимости антибиотического эффекта от штамма-антагониста при использовании одной и той же тест-культуры (Fus C15):

1 – штамм RSA9, подавление роста тест-культуры ярко выражено; 2 – штамм RSA4, подавление роста тест-культуры отсутствует

Пример зависимости антибиотического эффекта от тест-культуры при использовании одного и того же штамма-антагониста (RSA2): 1 – тест-культура Alt C20, подавление роста тест-культуры ярко выражено; 2 – тест-культура Fus C15, подавление роста тест-культуры выражено слабо

Рисунок 3 - Пример зависимости антибиотического эффекта от тест-культуры при использовании одного и того же штамма-антагониста (RSA2):

1 – тест-культура Alt C20, подавление роста тест-культуры ярко выражено; 2 – тест-культура Fus C15, подавление роста тест-культуры выражено слабо

Дисперсионный анализ показал статистически значимое влияние факторов «штамм-антагонист» (p<0,001, показатель силы влияния 57,33%) и «тест-культура гриба» (p<0,001, показатель силы влияния 15,87%), а также взаимодействия этих факторов (p<0,001, показатель силы влияния 26,16%) на подавление роста тест-культур.
В среднем по тест-культурам максимальный антибиотический эффект проявил штамм СХ6, минимальный – штамм RSA12 (рис. 4).
Антибиотический эффект изучаемых штаммов в среднем по тест-культурам

Рисунок 4 - Антибиотический эффект изучаемых штаммов в среднем по тест-культурам

В среднем по изучаемым штаммам максимальную чувствительность к их антибиотическому действию проявил изолят р. Alternaria Alt C24, минимальную – изолят р. Fusarium Fus C15 (рис. 5)
Площадь колоний тест-культур в % к контролю в присутствии антагонистов с усреднением по штаммам

Рисунок 5 - Площадь колоний тест-культур в % к контролю в присутствии антагонистов с усреднением по штаммам

Результаты попарного сравнения тест-культур по средней чувствительности к набору изученных антагонистов представлены в таблицах 2 и 3.

Таблица 2 - Статистическая значимость попарных различий между тест-культурами по средней чувствительности к набору изученных штаммов-антагонистов

Тест-культура

Alt C20

Alt C24

Fus C7

Fus C15

Alt C20

-

<0,001

<0,001

<0,001

Alt C24

<0,001

-

<0,001

<0,001

Fus C7

<0,001

<0,001

-

<0,001

Fus C15

<0,001

<0,001

<0,001

-

Scler C16

нет

0,001

<0,001

<0,001

Примечание: тест Шеффе

Таблица 3 - Статистическая значимость попарных различий между тест-культурами по средней чувствительности к набору изученных штаммов-антагонистов

Тест-культура

Alt C20

Alt C24

Fus C7

Fus C15

Alt C20

-

<0,001

<0,001

<0,001

Alt C24

<0,001

-

<0,001

<0,001

Fus C7

<0,001

<0,001

-

<0,001

Fus C15

<0,001

<0,001

<0,001

-

Scler C16

<0,05

<0,001

<0,001

<0,001

Примечание: тест Тьюки

Между тест-культурами выявлены статистически значимые положительные корреляции по чувствительности к изучаемым штаммам-антагонистам. Особенно высокая корреляция (r= 0,832) наблюдалась между Fus C7 и Fus C15. В то же время чувствительность Scler C16 к изучаемым штаммам относительно слабо коррелировала с чувствительностью Alt C20 и Alt C24, и практически не коррелировала с чувствительностью Fus C7 и Fus C15 (табл. 4).

Таблица 4 - Коэффициенты корреляции Пирсона между тест-культурами по чувствительности к антибиотическому действию изучаемых штаммов

Тест-культура

Alt C20

Alt C24

Fus C7

Fus C15

Scler C16

Alt C20

1,000

0,786

0,796

0,739

0,561

Alt C24

0,786

1,000

0,787

0,679

0,495

Fus C7

0,796

0,787

1,000

0,832

0,304

Fus C15

0,739

0,679

0,832

1,000

0,366

Scler C16

0,561

0,495

0,304

0,366

1,000

Примечание: коэффициенты корреляции, статистически значимые на уровне p<0,05, выделены жирным шрифтом

Факторный анализ показал, что наблюдаемое (см. табл. 1) варьирование тест-культур по чувствительности к антибиотическому действию изучаемых штаммов на 87,8% определяется действием двух главных факторов (рис. 6, табл. 5).
Диаграмма величин собственных значений матрицы коэффициентов корреляции, представленной в таблице 4

Рисунок 6 - Диаграмма величин собственных значений матрицы коэффициентов корреляции, представленной в таблице 4

Таблица 5 - Главные факторы, выделенные при анализе представленной в таблице 4 матрицы коэффициентов корреляции

Тест-культура

Без вращения

Варимаксное вращение

Фактор 1

Фактор 2

Фактор 1

Фактор 2

Alt C20

-0,926

-0,056

0,799

0,472

Alt C24

-0,896

0,003

0,799

0,406

Fus C7

-0,904

0,328

0,955

0,120

Fus C15

-0,872

0,255

0,892

0,170

Scler C16

-0,599

-0,785

0,176

0,972

Собственное значение

3,597

0,792

3,015

1,375

% вариации

71,9

15,8

60,3

27,5

Примечание: факторные нагрузки больше 0,70 выделены жирным шрифтом

Результаты факторного анализа можно интерпретировать как наличие у изучаемых штаммов как минимум двух антибиотических соединений, различающихся спектром антифунгального действия. Первое соединение (Фактор 1) активно в отношении Alt C20, Alt C24, Fus C7 и Fus C15, второе соединение (Фактор 2) активно в отношении Scler C16. При этом ни один из изученных штаммов-антагонистов не оказался максимально эффективным одновременно по обоим факторам (рис. 7). Это ведёт к необходимости при разработке биопрепаратов для борьбы с возбудителями грибных болезней сои использовать комплексные препараты на основе нескольких штаммов-антагонистов, различающихся по спектру антифунгального действия. Данный вывод хорошо согласуется с результатами ранее проведённых нами аналогичных исследований, в которых изучали антибиотическую активность штаммов-антагонистов сем. Bacillaceae в отношении возбудителей грибных болезней рапса
.
Проекция штаммов-антагонистов на оси, представляющие Фактор 1 и Фактор 2

Рисунок 7 - Проекция штаммов-антагонистов на оси, представляющие Фактор 1 и Фактор 2

Примечание: см. табл. 5, без вращения

4. Заключение

Проверка антибиотической активности 22 штаммов Bacillus altitudinis, B. atrophaeus, B. cereus, B. megaterium, B. simplex, B. subtilis, Peribacillus simplex и Bacillus sp., выделенных из почв Красноярского края, в отношении актуальных для региона возбудителей грибных болезней сои р.р. Alternaria и Fusarium, а также Sclerotinia sclerotiorum, показала, что эта активность статистически значимо зависит как от штамма бактерий, так и от таксономического положения возбудителя. В среднем по штаммам-антагонистам максимальную чувствительность к их антибиотическому действию проявил изолят Sclerotinia sclerotiorum, минимальную – представители р. Fusarium. Среди штаммов-антагонистов максимальную антифунгальную активность в среднем по изолятам фитопатогенных грибов проявил штамм Bacillus atrophaeus СХ6. В то же время спектр чувствительности фитопатогенных грибов к штаммам-антагонистам, равно как и спектр антифунгальной активности антагонистов, различается. Это подтверждается наличием статистически значимого эффекта взаимодействия факторов «штамм-антагонист» и «тест-культура гриба». Корреляционный анализ с последующим факторным анализом матрицы корреляций показал, что изучаемые штаммы продуцируют как минимум два антигрибных антибиотика, различающихся спектром действия. При этом интенсивность продуцирования этих антибиотиков у разных штаммов различается. В этой связи для защиты сои от грибных болезней необходимо использовать комбинации штаммов, различающихся по спектру антифунгальной активности. На основании результатов нашего исследования, для почвенно-климатических условий Красноярского края можно рекомендовать комбинацию штаммов Bacillus atrophaeus СХ6 и Pa2 Bacillus sp.

Article metrics

Views:81
Downloads:2
Views
Total:
Views:81