EPIDEMIOLOGICAL CHARACTERISTICS OF THE DYNAMICS OF A NEW CORONAVIRUS INFECTION (COVID-19) IN THE REPUBLIC OF SAKHA (YAKUTIA)

Research article
DOI:
https://doi.org/10.23670/IRJ.2022.115.1.057
Issue: № 1 (115), 2022
Published:
2022/01/24
PDF

Abstract

In 2019, humanity faced a new viral infection SARS-CoV-2 (COVID-19). The epidemic of a new coronavirus infection (COVID-19) has spread rapidly in China and has developed into a global pandemic. The main features of the COVID-19 virus are its high contagiousness, virulence and tropism to many cells of human organs. Epidemiological characteristics are characterized by an average incubation period of 5.2 days, a doubling of the number of cases - 7.4 days, the basic reproductive index - 2.2. The article discusses the main epidemiological features of the new coronavirus infection (COVID-19) in the Republic of Sakha (Yakutia) and analyzes the results of the vaccination in the region using various vaccine preparations are analyzed. A retrospective analysis of virological diagnostics during the seasonal rise of acute respiratory viral infections revealed up to 24.8% of patients with new coronavirus infection among the examined patients suffering from acute respiratory viral infections. During the seasonal rise of SARS in the Republic of Sakha (Yakutia), there is an active circulation of parainfluenza viruses (up to 43.5%) among SARS patients, as well as adenoviruses (up to 31.1%).

ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ ДИНАМИКИ НОВОЙ КОРОНАВИРУСНОЙ ИНФЕКЦИИ (COVID-19) В РЕСПУБЛИКЕ САХА (ЯКУТИЯ)

Научная статья

Борисова А.А.1, *, Попова Н.Д.2, Кычкина А.И.3, Рожина А.А.4, Федулова А.Г.5

1 ORCID: 0000-0001-5243-7130;

2 ORCID: 0000-0003-3391-6616;

1, 2, 3, 4, 5 Северо-Восточный федеральный университет им. М.К. Аммосова, Якутск, Россия

* Корреспондирующий автор (ann_borisova95[at]mail.ru)

Аннотация

В 2019 году человечество было поражено новой вирусной инфекцией SARS-CoV-2 (COVID-19). Эпидемия новой коронавирусной инфекции (COVID-19) стремительно распространилась в Китае и переросла в глобальную пандемию. Основными особенностями вируса COVID-19 является его высокая контагиозность, вирулентность и тропизм ко многим клеткам органов человека. Эпидемиологические характеристики характеризуются средним инкубационным периодом 5,2 дня, удвоение числа случаев – 7,4 дня, базовый репродуктивный показатель – 2,2.

В статье рассмотрены основные эпидемиологические особенности новой коронавирусной инфекции (COVID-19) на территории Республики Саха (Якутия). Проанализированы результаты вакцинации населения республики различными вакцинными препаратами.

Ретроспективный анализ вирусологической диагностики в период сезонного подъёма ОРВИ, позволил выявить среди обследованных больных с ОРВИ до 24,8% больных новой коронавирусной инфекцией.

В период сезонного подъёма ОРВИ в Республике Саха (Якутия), отмечается активная циркуляция среди больных ОРВИ вирусов парагриппа до 43,5%, а также аденовирусов до 31,1%.

Ключевые слова: динамика заболеваемости, показатель заболеваемости, структура заболевших, новая коронавирусная инфекция (COVID-19), вакцинация, заболеваемость привитых.

EPIDEMIOLOGICAL CHARACTERISTICS OF THE DYNAMICS OF A NEW CORONAVIRUS INFECTION (COVID-19) IN THE REPUBLIC OF SAKHA (YAKUTIA)

Research article

Borisova A.A.1, *, Popova N.D.2, Kychkina A.I.3, Rozhina A.A.4, Fedulova A.G.5

1 ORCID: 0000-0001-5243-7130;

2 ORCID: 0000-0003-3391-6616;

1, 2, 3, 4, 5 North-Eastern Federal University, Yakutsk, Russia

* Corresponding author (ann_borisova95[at]@mail.ru )

Abstract

In 2019, humanity faced a new viral infection SARS-CoV-2 (COVID-19). The epidemic of a new coronavirus infection (COVID-19) has spread rapidly in China and has developed into a global pandemic. The main features of the COVID-19 virus are its high contagiousness, virulence and tropism to many cells of human organs. Epidemiological characteristics are characterized by an average incubation period of 5.2 days, a doubling of the number of cases - 7.4 days, the basic reproductive index - 2.2.

The article discusses the main epidemiological features of the new coronavirus infection (COVID-19) in the Republic of Sakha (Yakutia) and analyzes the results of the vaccination in the region using various vaccine preparations are analyzed.

A retrospective analysis of virological diagnostics during the seasonal rise of acute respiratory viral infections revealed up to 24.8% of patients with new coronavirus infection among the examined patients suffering from acute respiratory viral infections.

During the seasonal rise of SARS in the Republic of Sakha (Yakutia), there is an active circulation of parainfluenza viruses (up to 43.5%) among SARS patients, as well as adenoviruses (up to 31.1%).

Keywords: morbidity dynamics, morbidity index, structure of cases, new coronavirus infection (COVID-19), vaccination, morbidity among the vaccinated.

Введение

В конце января 2020 года генеральный директор ВОЗ Тедрос Аданом Гебрейесус объявил вспышку коронавируса (nCoV-2019) чрезвычайной ситуацией международного значения в области общественного здравоохранения [1], [2], [3]. Постановлением правительства Российской Федерации коронавирусная инфекция (2019-nCoV) внесена в Перечень заболеваний, представляющих опасность для окружающих [4]. Также летом этого года появился новый дельта-штамм коронавирусной инфекции, который является более опасным, чем изначальный альфа-штамм [5], [6], [7].

Цель: оценить эффективность вакцинопрофилактики, применяемых вакцинных препаратов.

Задачи:

  1. Исследовать распространение новой коронавирусной инфекции (COVID-19) среди населения Республики Саха (Якутия) в период с января 2021г. по 9 ноября 2021 г. (44 недели 2021г).
  2. Проанализировать результаты вакцинации населения РС(Я) различными вакцинными препаратами и заболеваемость коронавирусной инфекции среди привитых медработников.

Материалы и методы: федеральные, региональные нормативно-правовые документы, статистические материалы Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по РС(Я).

Результаты и их обсуждения

По состоянию на 9 ноября 2021г. за текущий год (в период с января по 9 ноября 2021г.) зарегистрировано 64718 случаев новой коронавирусной инфекции в Республике Саха (Якутия), показатель заболеваемости на 100 тысяч населения составляет 6675,4 - недельный темп прироста составляет 0,3%.

Коэффициент распространенности инфекции в ноябре равен - 1.00, уровень летальности - 2,35%, уровень смертности 156,6 на 100 тысяч населения.

03-02-2022 16-40-02

Рис. 1 – Помесячная динамика заболеваемости в РС(Я) с января по сентябрь 2021 г.

 

В помесячной динамике отмечается рост заболеваемости новой коронавирусной инфекции в августе на 35%, в сентябре на 15,2%, в октябре на 56,8%.

При проведении лабораторной диагностики больных с ОРВИ, начиная с 42 недели 2021 года отмечается рост положительных результатов новой коронавирусной инфекции COVID-19 до 13,4% от числа обследованных лиц. Лабораторная диагностика пневмоний выявила также увеличение удельного веса положительных результатов на COVID-19 с 42 недели эпидемиологического мониторинга за 2021г, который к 44 неделе увеличился до 56,3%.

Удельный вес детей, заболевших новой коронавирусной инфекцией за период наблюдения составляет 20,7-21,5% в помесячной динамике, а взрослых от 78,5-79,8%. Наибольший показатель заболеваемости наблюдался в возрастной группе 65 лет и старше, который составил 340,9 на 100 тысяч населения.

В структуре заболевших за 9 месяцев 2021 г. преобладал процент среди контингента – прочих работающих, который составил 34,2%. Удельный вес заболевших пенсионеров составил 29,4%, учащихся – 12,8%, работники образования – 3,0%, медицинские работники – 1,9%.

В эпидемических очагах больных новой коронавирусной инфекцией семейные источники составили 38,9% заболевших, по месту работы/учебы заразились – 2,9% больных.

В Республике Саха (Якутия) функционирует 19 ПЦР-лабораторий в г. Якутске и 6 лабораторий в районах.

Охват тестированием населения всеми методами лабораторной диагностики новой коронавирусной инфекции (ПЦР, ИХА, ИФА) за время наблюдения составил 367,8 на 100 тысяч населения.

В структуре выявленных штаммов в июне удельный вес дельта штамма составлял 20%, а уже в августе дельта штамм составил 92% от всех выявленных штаммов. Таким образом дельта-штамм вытеснил остальные и стал доминантным.

По данным вирусологической лаборатории ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в РС(Я)» всего за период сезонного подъёма ОРВИ (35-44 неделя 2021г.) было обследовано 1782 больных с ОРВИ. Ретроспективный анализ выявил наибольший удельный вес больных парагриппом 43,5% (218 человек), новой коронавирусной инфекции 24,5% (124 человек), аденовирусной инфекции 31,1% (156 человек). Среди больных с пневмонией, в период эпидсезона ОРВИ, лабораторная вирусологическая диагностика выявила COVID-19 от 32,4 до 56,3%.

03-02-2022 16-40-15

Рис. 2 – Структура вирусологической диагностики ОРВИ

 

Всего за весь период наблюдения бессимптомное течение составило 3973 – 6.2%, легкой степени 40443 случая – 62.8%, средней степени 17718 случаев – 27.5%, тяжелой степени 2292 случая – 3.6%.

Секвенирование генома SARS-CoV-2 позволило начать массовую разработку вакцин против COVID-19. Вакцинация считается одним из самых важных достижений медицины в истории и, по подсчетам ВОЗ, каждый год предотвращает 2-3 миллиона смертей от инфекционных болезней [8].

В Республике Саха (Якутия) вакцинация против COVID-19 проводится в 45 медицинских организациях республики, в которых развернуто 273 пункта вакцинации, созданы 140 мобильных бригад, 20 мобильных пунктов вакцинации. Суточная пропускная способность 14000 человек.

Коллективный иммунитет, являющийся наиболее эффективным средством предотвращения распространения заболевания, формируется двумя путями – пассивным (формирование невосприимчивого к повторному инфицированию контингента вследствие естественного распространения заболевания) и активным (массовая вакцинация населения) [9], [10].

За период наблюдения первую вакцинацию против новой коронавирусной инфекции в Республике Саха (Якутия) получили 416406 человек - 58,1% от взрослого населения. Темп иммунизации за последние недели увеличился в 3 раза.

За весь период эпидемиологического наблюдения (44 недели 2021 года) охват вакцинацией медицинских работников составил 78,5%, работников образовательных учреждений – 83,2%, работников предприятий промышленности – 87,6%, служащие (офисные) – 41,2%, работники сферы обслуживания 23,7%, лица старше 60 лет – 82,4%. С учетом эпидемиологической ситуации план вакцинации был откорректирован до 80% населения.

 

Таблица 1 – Вакцинация населения РС(Я) по состоянию за 44 недели текущего года

Спутник V ЭпиВакКорона КовиВак Всего
Всего привитых V1 249222 69186 2074 320482
Удельный вес от числа привитых заболевших после иммунизации 1,3% 1,4% 1,5% 1,3%
Всего случаев заболеваний 3156 941 32 4129
Всего после V1 435 (13,8%) 116 (12,3%) 6 (18,7%) 557 (13,5%)
Всего после V2 2721 (86,2%) 825 (87,6%) 26 (81,2%) 3572 (86,5%)
 

Число заболевших COVID-19 среди вакцинированных против новой коронавирусной инфекции составило 4129 случаев – 1,3% от числа привитых. Необходимо отметить, что удельный вес привитых Спутником V составил 77,86%, ЭпиВакКорона 21,5%, КовиВак 0,64%.

Таким образом, эпидемиологическая эффективность вакцинации очевидна.

Заключение
  1. Эпидемиологический анализ за период с января по 9 ноября 2021 г. показал, что на территории Республики Саха (Якутия) регистрируется стабильно высокий уровень заболеваемости COVID-19, а значительный рост заболеваемости новой коронавирусной инфекции возрос с августа на 35%, а в октябре на 56,8%.
  2. Ретроспективный анализ лабораторно подтвержденных случаев заболеваний COVID-19 показал активную циркуляцию дельта штамма коронавирусной инфекции, который вытеснил бразильский и индийский штамм и стал доминантным – до 92% от всех выявленных штаммов.
  3. Эпидемиологическая эффективность вакцинации очевидна. Удельный вес заболевших среди вакцинированных против COVID-19 по состоянию за 44 недели текущего года составил 1,3% от общего количества привитых.
  4. В период сезонного подъёма ОРВИ, отмечается активная циркуляция SARS-CoV-2 (COVID-19) до 24,8% среди больных ОРВИ.
Конфликт интересов Не указан. Conflict of Interest None declared.

Список литературы / References

  1. Заявление по итогам второго совещания Комитета по чрезвычайной ситуации в соответствии с Международными медико-санитарными правилами, в связи со вспышкой заболевания, вызванного новым коронавирусом 2019 г. (nCoV) [Электронный ресурс] - URL: https://www.who.int/ru/news-room/detail/30-01 -2020-statement-on-the-second-meeting-of-the-intemational-health-regulations-(2005)-emergency-committee-regarding-the-outbreak-of-novel-coronavirus-(2019-ncov) (дата обращения: 10.11.2021 г.).
  2. Брико Н.И. Пандемия COVID-19. Меры борьбы с ее распространением в Российской Федерации / Н. И. Брико, И. Н. Каграманян, В. В. Никифоров и др. // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. - 2020. – Т. 19 (2). – С. 4-12.
  3. Shi, Y. An overview of COVID-19 / Shi, Y., Wang, G., Cai, Xp. et al. // J. Zhejiang Univ. Sci. B. - 2020.
  4. Постановление Правительства РФ от 31.01.2020 N 66 «О внесении изменения в перечень заболеваний, представляющих опасность для окружающих».
  5. Liu Y. The reproductive number of the Delta variant of SARS-CoV-2 is far higher compared to the ancestral SARS-CoV-2 virus / Y. Liu, J. Rocklöv // J Travel Med. - 2021.
  6. Li B. Viral infection and transmission in a large well-traced outbreak caused by the Delta SARS-CoV-2 variant. – medRxiv. – 2021.
  7. Wise J. Covid-19: Delta variant doubles risk of hospital admission compared with alpha variant, study shows / B. Li, Deng, K. Li et al. // BMJ. – 2021.
  8. Мурашко М. А. Организационные аспекты вакцинации против новой коронавирусной инфекции / М. А. Мурашко, О. М. Драпкина // Национальное здравоохранение. – 2021. – Т. 2 (1). – С. 5-11.
  9. Онищенко Г. Г. Сравнительная характеристика вакцин против COVID-19, используемых при проведении массовой иммунизации. / Г. Г. Онищенко, Т. Е. Сизикова, В. Н. Лебедев и др. // БИОпрепараты. Профилактика, диагностика, лечение. - 2021. – Т. 21(3). – С. 158-166.
  10. Цыганков П. Частота выявления положительных маркеров COVID-19 у лиц с различным прививочным анамнезом. / П. Цыганков, А. Б. Альникин, И. В. Кваше и др. // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. – 2021. Т. 20(3). – С. 4-7.

Список литературы на английском языке / References in English

  1. Zajavlenie po itogam vtorogo soveshhanija Komiteta po chrezvychajnoj situacii v sootvetstvii s Mezhdunarodnymi mediko-sanitarnymi pravilami, v svjazi so vspyshkoj zabolevanija, vyzvannogo novym koronavirusom 2019 g. (nCoV) [Statement on the Second Meeting of the International Health Regulations (2005) Emergency Committee Regarding the Outbreak of Novel Coronavirus (2019-nCoV)] [Electronic resource] - URL: https://www.who.int/ru/news-room/detail/30-01-2020-statement-on-the-second-meeting-of-the-intemational-health-regulations-(2005)-emergency-committee-regarding-the-outbreak-of-novel-coronavirus-(2019-ncov) (accessed: 10.11.2021). [in Russian]
  2. Briko N.I. Pandemija COVID-19. Mery bor'by s ee rasprostraneniem v Rossijskoj Federacii [The COVID-19 Pandemic. Measures to Combat Its Spread in the Russian Federation] / N. I. Briko, I. N. Kagramanjan, V. V. Nikiforov et al. // Jepidemiologija i Vakcinoprofilaktika [Epidemiology and Vaccinal Prevention]. - 2020. – Vol. 19 (2). – pp. 4-12. [in Russian]
  3. Shi, Y. An overview of COVID-19 / Shi, Y., Wang, G., Cai, Xp. et al. // J. Zhejiang Univ. Sci. B. - 2020.
  4. Postanovlenie Pravitel'stva RF ot 31.01.2020 N 66 «O vnesenii izmenenija v perechen' zabolevanij, predstavljajushhih opasnost' dlja okruzhajushhih» [Decree of the Government of the Russian Federation of 31.01.2020 No. 66 “On Amendments to the List of Diseases That Pose a Danger to Others”]. [in Russian]
  5. Liu Y. The reproductive number of the Delta variant of SARS-CoV-2 is far higher compared to the ancestral SARS-CoV-2 virus / Y. Liu, J. Rocklöv // J Travel Med. - 2021.
  6. Li B. Viral infection and transmission in a large well-traced outbreak caused by the Delta SARS-CoV-2 variant. – medRxiv. – 2021.
  7. Wise J. Covid-19: Delta variant doubles risk of hospital admission compared with alpha variant, study shows / B. Li, Deng, K. Li et al. // BMJ. – 2021.
  8. Murashko M. A. Organizacionnye aspekty vakcinacii protiv novoj koronavirusnoj infekcii [Organizational Aspects of Vaccination Against a New Coronavirus Infection] / M. A. Murashko, O. M. Drapkina // Nacional'noe zdravoohranenie [National Healthcare]. – 2021. – Vol. 2 (1). – pp. 5-11. [in Russian]
  9. Onishhenko G. G. Sravnitel'naja harakteristika vakcin protiv COVID-19, ispol'zuemyh pri provedenii massovoj immunizacii [Comparative Characteristics of Vaccines Against COVID-19 Used in Mass Immunization]. / G. G. Onishhenko, T. E. Sizikova, V. N. Lebedev et al. // BIOpreparaty. Profilaktika, diagnostika, lechenie. [BIOpreparations. Prevention, Diagnosis, Treatment.] - 2021. – Vol. 21(3). – pp. 158-166. [in Russian]
  10. Cygankov P. Chastota vyjavlenija polozhitel'nyh markerov COVID-19 u lic s razlichnym privivochnym anamnezom [Frequency of Detection of Positive COVID-19 Markers in Individuals With Various Vaccination History]. / P. Cygankov, B. Al'nikin, I. V. Kvashe et al. // Jepidemiologija i Vakcinoprofilaktika [Epidemiology and Vaccinal Prevention]. – 2021. Vol. 20(3). – pp. 4-7. [in Russian]