Метод виртуального скрининга

Принцип работы

Преимущества

Недостатки

Лиганд-ориентированный скрининг

Фокусируется на поиске лигандов (молекул, обладающих химическими свойствами) для взаимодействия с целевым белком.

Позволяет исследовать большие химические библиотеки.

Может быть эффективен, когда структура белка не полностью известна.

Может игнорировать важные структурные особенности белка.

Работает лучше, когда есть хороший лиганд с известной активностью.

Структурно-ориентированный скрининг

Основан на использовании трехмерной структуры целевого белка для поиска молекул, подходящих по форме и взаимодействующих с конкретными сайтами.

Учитывает структурные особенности активного сайта белка.

Может обнаруживать новые лиганды, неизвестные из ранее проведенных экспериментов.

Требует полной или частичной структуры белка. Может быть менее эффективным, когда активный сайт малоподвижен или изменчив.